Не смотря на высокие дозы ядовитого вещества и неприятные ощущения, АКТ является очень безопасной процедурой. За всю историю АКТ в США зафиксирован лишь один смертный случай — сердечная аритмия и остановка сердца у мужчины на следующий день после АКТ. Безопасность использования атропина подтверждается своеобразными пороговыми дозировками: дозы до 1 мг вызывают тахикардию, до 10−20 мг опьянение и галлюцинации, свыше 100 мг состояние пациента в коме не отличается от нормального по всем показателям, кроме отсутствия сознания. Объясняется это угнетением атропином гипоталамуса. Перед АКТ больному дается премедикация, которая снимает все неприятные ощущения, такие, как тошнота и тревога, и ограничивает силу симпатоадреналовой реакции на АКТ (тахикардию и подъем артериального давления). Атропин вводится внутривенно, струйно, в виде концентрированного 1% или 2,5% раствора — и коматозное состояние наступает очень быстро, в считанные минуты, а иногда и секунды. Сеанс АКТ длится 3−4 часа, а иногда и 1.5−2 часа, по окончании положенного времени атропиновую кому купируют внутривенным введением антидота нивалина. Для большей безопасности, АКТ проводят c полным аппаратным мониторингом всех параметров жизнеобеспечения — пульса, дыхания, давления, содержания кислорода в крови и записью ЭКГ во время сеанса. Во время всего сеанса АКТ параллельно идет по вене медикаментозная седация: пропофол, дормикум или тиопентал. В начале времён, в 1950—1960-е годы, атропинокоматозную терапию применяли достаточно длительными курсами, до 15−25 ком на курс. И стремились постепенно довести дозу атропина к концу курса до 300 мг зараз. При этом к концу курса атропин накапливался в организме и у больных наблюдались симптомы кумуляции атропина — запоры, сильный тремор рук, двоение в глазах, тошнота, не проходящая между сеансами тахикардия, мышечная слабость, сонливость, вялость, апатия, «пьяная походка», заторможенность, снижение аппетита, значительная потеря веса (до 10−15 кг за время курса), своеобразная «погруженность в себя», напоминающая аутизм при шизофрении, и т. д. В общем, неприятно. Эти все явления проходят, когда атропин выветривается, но все равно неприятно и мучительно. Сегодня АКТ обычно применяют более коротким курсом (5−7, до 10, редко до 14 ком на курс). И с большими интервалами между сеансами. И с обильной гидратацией и мочегонными. И коматозную дозу редко доводят более чем до 150−200 мг на сеанс. Так что атропин между сеансами успевает покинуть организм и явления кумуляции атропина не развиваются.
Атропинокоматозная терапия эффективна при лечении депрессий, в том числе резистентных к антидепрессантам. Эффективна при лечении шизофрении — в том числе поливалентно резистентной к разным нейролептикам, так же АКТ успешно снимает все симптомы синдрома отмены опиоидов.

К настоящему времени трудами главным образом польских и отечественных исследователей выработана определенная техника проведения атропиновой комы. Для атропинокоматозной терапии не требуется ни специального помещения, ни какой-либо аппаратуры или дополнительного оборудования. Терапию проводят в обычной больничной палате, окна которой несколько затеняют на время проведения атропинокоматозной терапии